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miércoles, 30 de julio de 2008

Electroforesis Bidimensional (Gel 2D) y software recomendado

La electroforesis bidimensional permite la identificación de una proteína particular en una mezcla proteica compleja, actualmente se ha convertido en la técnica mas empleada para comparación de contenidos proteicos entre dos o más muestras.


Concepto
El estudio de proteínas es de gran interés en el área médica. Muchos fármacos son de naturaleza proteica y muchas moléculas diana son proteínas. Dependiendo del pH del medio en el que se encuentre, una proteína tendrá carga positiva o negativa o no estará cargada. El valor de pH en el que una proteína presenta carga neta 0 es conocido como “punto isoeléctrico” y es característico de cada proteína. La electroforesis bidimensional es una técnica que permite la separación de mezclas complejas de proteínas. La separación se hace en dos etapas consecutivas. En la primera de ellas (“primera dimensión”) las proteínas son separadas en función de su carga a lo largo de un gel con gradiente de pH. Cada proteína avanza en el campo eléctrico hasta alcanzar un valor de pH igual a su punto isoeléctrico. En una segunda etapa (“segunda dimensión”), estas proteínas son separadas entre sí en función de su masa molecular. La visualización del resultado de estas dos electroforesis muestra el conjunto de proteínas presentes en la mezcla inicial. La electroforesis bidimensional se emplea en estudios comparativos de patrones proteicos de diferentes individuos. Pueden compararse por ejemplo, los patrones de proteínas de un individuo sano frente a un individuo enfermo o de un mismo individuo expuesto a diversas situaciones. Estas estrategias se utilizan para analizar los efectos de diferentes tratamientos con fármacos o la exposición a sustancias tóxicas.

Fuente y Vinculos relacionados:
Medicina Molecular
Bioinformática


SOWTWARE PARA EL PROCESAMIENTO DE GELES 2D
Actualmente existen varios software que es posible obtener por internet gratis durante su periodo de prueba que varia de 3 dias a 30 dias, los mismos pueden ser comprados por diferentes laboratorios, alguno de estos son:

PdQuest (Bio-rad)

Delta 2D (Decodon)

Malanie 7.0

Para que puedan descargar estos programas deben antes inscribirse gratuitamente y dar su verdadero correo, una vez hecho esto pueden tener acceso a la descarga.
Espero les sean útiles estos enlaces y si conocen otros software porfavor haganlo saber con un comentario.

1 comentario:

william dijo...

hola, me gustaria bajar este articulo porque me interesa mucho.
como lo puedo bajar?